学校在被称为“学府胜地”的北京市海淀区建有东西两个校区，总面积近1000亩，建筑面积100余万平方米；在山东省威海市建有威海校区，以中外合作办学为特色，占地面积1000余亩；各校区均具备完善的教学、科研设施，校园环境优美。在河北省黄骅市建有北京交通大学海滨轨道交通综合研发实验基地；在北京市丰台区打造国际一流的轨道交通“产学研用”一体化创新基地；在河北省唐山市成立唐山研究院，着力打造技术研发、成果转化的示范区；建有深圳研究院、长三角研究院以及威海研究院，为拓宽社会资源，推动学校人才培养与科学研究做出积极贡献。目前，雄安校区已开启大规模建设，学校一校多区协同发展进入崭新阶段。
北京交通大学本部地处北京市海淀区西直门，恰在北京二环边上，是距离天安门最近的重点大学之一，学校临近国家图书馆、中关村、北京展览馆、北京动物园、西直门地铁站、各大型超市等，地理位置优越且交通便利。更是与中央财经大学、北京师范大学、北京电影学院等多所院校相邻，各路人才云集于此，学习交流零距离。